Постепенно восстанавливалась и промышленность. К концу 1945 г. из 15 разрушенных в районе предприятий восемь были восстановлены и давали продукцию.
На фронтах еще шли бои, а архитекторы уже задумывались над будущим Истры. К разработке проекта планировки и застройки города приступили в 1943 г. Интересен проект восстановления Истры, предложенный А. В. Щусевым. Учитывая прежде всего топографические особенности местности, исключительное значение района как водоохранной зоны, близость к Москве, Щусев полагал, что г. Истра «должен быть создан как город-сад, город-здравница, любимое место прогулок и отдыха трудящихся Москвы». Он писал: «Здесь будет как бы наше северное Сочи с набережными и парками, с видом вместо моря на живописную долину реки». Проект предусматривал расселение в городе 10-12 тыс. жителей, строительство специальных курортных зданий, пансионатов, туристских баз. Предполагалось, что застройка города останется малоэтажной и по преимуществу деревянной. Ведущим архитектурным зданием города должно было стать здание райисполкома на главной площади, построенное по типу городской ратуши, перекликающееся по архитектуре с Новоиерусалимским монастырем. В застройке Истры предлагалось применить тип «нарядной жизнерадостной архитектуры XVII в.».
Проект А. В. Щусева не был осуществлен. Шла война, и нужно было прежде всего думать о том, как быстрее обеспечить горожан жильем, наладить экономическую жизнь города.
Медленно поднимался город из руин. После его освобождения застройка Истры шла главным образом по линии индивидуального строительства. Государство оказывало материальную помощь пострадавшим во время оккупации, выдавало долгосрочные ссуды. К концу 1946 г. в городе было построено 168 индивидуальных домов, к началу 1948 г. число их возросло до 267. В годы четвертой пятилетки в Истре были введены в строй новый универмаг, кинотеатр на 300 мест, еще одна школа (им. Чехова), книжный магазин, открыты детский сад и ясли, налажена работа городской библиотеки.
Совершенно заново создавалась городская промышленность, прежде всего местного характера. Одним из первых начал действовать райпромкомбинат, состоявший из нескольких цехов (столярный, кожгалантерейный, строительный и др.). К середине 50-х гг. в Истре работали: завод металлоизделий, СМУ, завод фруктовых вод, колбасная фабрика, хлебозавод. Все эти предприятия имели небольшое число рабочих. Восстанавливались или заново создавались промысловые артели – швейные, мебельные и др. В конце 50-х гг. на их основе созданы фабрики (Лучинская швейная, Истринская и Нахабинская мебельные фабрики).